D alam praktik, dokter gigi seringkali menemukan kasus ulserasi yang timbul rekuren pada mukosa mulut. Salah satu kasus rekuren ini adalah stomatitis aftosa rekuren (SAR). Angka prevalensi SAR berkisar 20% dari populasi umum. Andrographis paniculata merupakan tumbuhan yang banyak digunakan dalam bidang kedokteran karena memiliki sifat antihepatotosik, anti-malarial, anti-inflamasi, antioksidan, antimikroba, anti-cancer, antivirus, antivenom, analgesik dan antipiretik. Pada bidang kedokteran gigi, A. paniculata belum ada dasar ilmiah dalam penggunaan bahan tersebut. Tujuan: untuk mengetahui efek A. paniculata terhadap kesembuhan lesi SAR dibandingkan klorheksidin glukonat dan tetrasiklin sebagai obat kumur. Metode: Jenis penelitian eksperimental dengan rancangan potong-silang. Subyek sebanyak 15 pasien SAR yang berobat ke RSGM, dibagi ke 3 kelompok perlakuan, yaitu A. paniculata 0,6%, klorheksidin glukonat 0,1% dan tetrasiklin 1,6%. Skor rasa sakit dicatat setiap hari menggunakan VAS. Pemeriksaan lesi oral dilakukan pada hari ke-1, 7 dan 10. Analisis data menggunakan uji Kruskal-Wallis. Hasil: Berdasarkan skor rasa sakit yang diukur sebelum dan selama terapi, dalam tiap kelompok terdapat perbedaan (P=0,066; P=0,043; P=0,039); tetapi tidak ada perbedaan selisih skor rasa sakit sebelum dan selama terapi antar semua kelompok (P=0,255). Tidak terdapat perbedaan durasi kesembuhan antar semua kelompok (P=0,527). Rerata durasi kesembuhan kelompok A. paniculata, klorheksidin glukonat dan tetrasiklin masing-masing adalah 4,6 hari; 6,2 hari; 4,2 hari. Berdasarkan ukuran lesi, tidak ada perbedaan penurunan ukuran lesi dari sebelum terapi sampai kunjungan kedua antar kelompok (P=0,291). Kesimpulan: A. paniculata berpengaruh terhadap kesembuhan lesi SAR setara klorheksidin glukonat dan tetrasiklin.