T ujuan dari penelitian ini adalah untuk mengetahui pengendalian internal yang diterapkan pada sistem informasi akuntansi penggajian di Kantor Pusat Bank Indonesia. Pengendalian internal merupakan hal yang harus diperhatikan oleh manajemen agar tidak terjadi kecurangan atau kesalahan atas kegiatan operasi yang berdampak pada asset perusahaan, keakuratan dan keandalan data, efektivitas dan efisiensi serta kebijakan perusahaan. Penulis mengevaluasi dan menganalisis keunggulan serta kekurangan yang terjadi pada pengendalian internal dalam sistem penggajian tersebut kemudian menyarankan perbaikan yang perlu dilakukan manajemen untuk meminimalisasi resiko. Penelitian ini merupakan penelitian deskriptif yang dipaparkan dengan analisis kualitatif. Data diambil dari Kantor Pusat Bank Indonesia Jakarta melalui teknik observasi, wawancara dan dokumentasi. Hasil dari penelitian ini yaitu Kantor Pusat Bank Indonesia telah menerapkan sebagian besar pengendalian internal dengan baik pada sistem penggajiannya. Namun, terdapat beberapa hal yang belum diterapkan yaitu kurangnya pemberlakuan sanksi bagi pegawai yang melakukan kesalahan, deadline cut-off yang tidak terpenuhi, pengambilan sampel dalam pemeriksaan serta frekuensi audit yang dilakukan masih belum maksimal.