L atar belakang: Perawatan kanker konvensional dapat menimbulkan efek samping, sehingga perlu dikembangkan perawatan alternatif menggunakan bahan alam. Ekstrak etanol kulit biji buah Borassus flabellifer L. mengandung senyawa flavonoid dan fenolik yang dapat menginduksi apoptosis sel kanker. Pembelajaran kualitatif efek antikanker ekstrak etanol kulit biji buah Borassus flabellifer L. dapat dilakukan melalui pengamatan proses apoptosis dalam bentuk perubahan morfologi sel Tujuan: Untuk mengetahui efek sitopatik ekstrak etanol kulit biji buah Borassus flabellifer L. dalam bentuk perubahan morfologi sel terhadap cell line HSC-3. Metode: Penelitian in vitro menggunakan cell line HSC-3 dan tujuh kelompok: kontrol negatif (hanya media kultur), kontrol positif (doxorubicin 3 μM), dan lima kelompok ekstrak kulit biji buah Borassus flabellifer L. (93,75 μg/mL, 187,5 μg/mL, 375 μg/mL, 750 μg/mL, dan 1500 μg/mL). Pengamatan morfologi sel menggunakan chamber slide, pewarnaan hematoksilin eosin, dan pengamatan mikroskopis setelah 24, 48, dan 72 jam. Analisa mencakup perubahan diameter inti sel, keberadaan fragmentasi inti sel dan vakuolisasi sitoplasma sel. Hasil: Terdapat pengecilan diameter inti sel signifikan pada kelompok ekstrak 750 μg / mL setelah 24 jam, dan 375 μg / mL setelah 48 dan 72 jam. Fragmentasi inti mulai terjadi pada semua well pada kelompok ekstrak 750 μg / mL setelah 24 jam, dan pada semua well setelah 48 dan 72 jam, serta menunjukkan perbedaan signifikan antara semua kelompok. Kesimpulan: Ekstrak etanol kulit biji buah Borassus flabellifer L. memiliki efek sitopatik terhadap cell line HSC-3 dalam bentuk perubahan morfologi sel.