K ereta Commuter Line (CL) Jakarta — Bogor merupakan salah satu sarana transportasi publik yang diandalkan oleh masyarakat. Pesatnya pertumbuhan akan kebutuhan transportasi dari wilayah Bogor ke Jakarta dan sebaliknya, dapat mengakibatkan padatnya lalu lintas kereta api sepanjang Jakarta-Bogor. Penggunaan rel yang sama oleh beberapa kereta api mengakibatkan keterlambatan perjalanan kereta api. Hal ini berdampak pada penumpukan penumpang dan tingginya load factor. Oleh karena itu diperlukan penelitian tentang optimalisasi penjadwalan agar dapat meminimasi keterlambatan perjalanan kereta api. Tujuan penelitian ini adalah mengevaluasi jadwal CL, merancang model penjadwalan CL, memberikan usulan perbaikan penjadwalan CL untuk meminimalkan keterlambatan. Model optmisasi penjadwalan kereta commuter menggunakan formulasi integer linear programming (ILP) menggunakan LINGO. Kondisi aktual mengalami total keterlambatan 725 menit terhadap jadwal tertulis. Hasil optimasi penjadwalan dengan ILP untuk kondisi aktual pada model awal adalah 628 menit. Perbaikan penjadwalan dengan model skenario I yaitu mengatur headway dengan mengurangi Tmax pada kereta k di jalur i yang mengalamai delay terbesar dihasilkan keterlambatan total sebesar 406 menit/ hari dalam 106 kereta dengan Nilai fiingsi objektif untuk kereta pagi adalah 112 menit ( 1.8 Jam), kereta slang adalah 103 menit ( 1.4 Jam), kereta sore adalah 129 menit ( 2.1 Jam), kereta malam adalah 62 menit (1 Jam ). Perbaikan model skenario II yaitu mengatur headway dengan menyesuaikan terhadap kereta luar kota pada jadwal sore hari. Solusi yang didapat pada model skenario II tidak ada keterlambatan utnuk masing-masing kereta api. Jumlah kereta yang terlambat dengan menggunakan model awal yaitu berkurang sebesar 0,13%, sedangkan menggunakan skenario I yaitu jumlah kereta yang terlambat sebesar 0,44 %, dan menggunakan skenario II yaitu jumlah kereta yang terlambat yaitu 0% atau tidak ada keterlambatan kereta dengan menggunakan skenario II.