P enelitian ini bermaksud untuk memanfaatkan biomassa algal blooming sebagai penyebab ketidakseimbangan ekosistem. Tujuan penelitian ini adalah menentukan a) tingkat produktivitas biomassa mikroalga hijau Chlorella sorokinian dan Closterium sp. sebagai bahan baku bahan bakar alternatif, b) kandungan lipid pada biomassa mikroalga dengan variasi N-anorganik dan suhu ekstraksi, c) minyak nabati yang berpotensi sebagai biodiesel. Pada penelitian ini, kultur campuran dikultivasi dengan teknik kultur batch secara bertahap dalam fotobioreaktor bervolume (Liter) 0,5; 1,5; dan 30. Kondisi lingkungan diatur sebagai berikut: pH 6, suhu 27oC, dan pencahayaan secara kontinyu dengan intensitas cahaya 2400 lux. Sumber nutrient menggunakan medium artifisial Provasoli Haematococcus Media (PHM) dengan variasi penambahan KNO3 sebagai sumber nitrogen sebanyak (%) 100; 50; 25; dan tanpa KNO3. Setelah diperoleh jumlah KNO3 optimum yang menghasilkan lipid paling tinggi, maka dilanjutkan dengan melakukan ekstraksi dengan bantuan alkohol, kloroform, dan aquades dengan perbandingan (1:1:1) dengan variasi temperatur (oC) 25; 30; dan 35. Selama proses kultivasi, analisis kepadatan sel dilakukan dengan menggunakan alat spektrofotometer UVVis. Analisis kadar lipid dan berat kering mikroalga dilakukan dengan Metode Bligh and Dyer. Biodiesel yang dihasilkan dari proses transesterifikasi diidentifikasi menggunakan alat Gas Chromatography Mass Spectrometry (GCMS). Hasil penelitian ini menunjukan bahwa dengan penambahan KNO3 sebesar 25%, suhu esktraksi optimum sebesar 35oC dan waktu pemanenan pada fase eksponensial, yaitu pada hari ke-9 dapat menghasilkan biomassa dan kadar total lipid tertinggi yaitu sebesar 2,56% (w/w) dan sebesar 77,94% (w/w). Hasil penelitian menunjukan dengan penurunan kadar KNO3 memberikan penurunan jumlah biomassa yang tidak signifikan namun kandungan total lipid mikroalga mengalami peningkatan. Penambahan KNO3 sebesar 25% menghasilkan kandungan lipid lebih tinggi yaitu 80,78% (w/w) dibandingkan dengan penambahan KNO3 sebesar 50% dan tanpa KNO3 menghasilkan kandungan lipid masing-masing sebesar 70,82% (w/w) dan 74,02% (w/w). Hasil analisis GCMS menunjukkan bahwa terdapat 5 kandungan asam lemak utama yang umumnya terkandung dalam biodiesel, yaitu asam palmitat yang sebesar 12,18%, asam oleat sebesar 3,55%, asam linoleat yang memiliki kandungan sebesar 6,69%, asam linolenat sebesar 21,62%, dan asam stearat sebesar 3,66% Dengan demikian, penelitian ini memberikan informasi bahwa kultur campuran mikroalga tropis Chlorella sorokinian dan Closterium sp. berdasarkan kandungan lipid dan asam lemak hasil ekstraksi Blight & Dyer menunjukan kandungan minyak yang dapat berpotensi sebagai bahan baku biodiesel.