M Makrozoobentos dapat digunakan sebagai indikator biologis dalam menentukan kualitas perairan di sungai. Penelitian ini dilakukan di Kali Baru Barat sepanjang 15 km. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi sumber pencemar yang ada di sekitar bantaran sungai, menghitung status mutu air, menghitung Indeks Keanekaragaman, Indeks Keseragaman dan Dominansi, dan mengetahui present status perairan menggunakan model ekologi yang terdiri dari Model Motomura, Model Broken Stick, dan Uji Jarak Matsusita. Penelitian ini dilakukan pada bulan April, Mei dan Juni 2019. Identifikasi sumber pencemar pada area seluas 200 m dari pinggir sungai. Sampling kualitas air dan bentos dilakukan pada 7 titik sampling. Kegiatan dominan di sekitar Kali Baru Barat adalah warung makan, bengkel dan pertokoan. Status Mutu air Kali Baru Barat berdasarkan Indeks Pencemar bernilai sebesar 8,73 (tercemar sedang). Hasil identifikasi makrozoobentos ditemukan sebanyak 7 kelas dengan 18 spesies. yaitu Bivalvia, Diptera, Gastropoda, Nematoda, Oligochaeta, Hirudinea, dan Crustaceae. Kelimpahan makrozoobentos berkisar antara 11.629 Ind/m2203 Ind/m2. Hasil perhitungan indeks ekologi diketahui bahwa Indeks Keanekaragaman (H') berkisar antara 0,2-1,35 menunjukkan kualitas perairan di Kali Baru Barat tergolong tercemar berat. Perbedaan nilai Indeks Pencemar dan nilai Indeks Keanekaragaman dikarenakan makrozoobentos memiliki sifat yang menetap diperairan dan mobilitas rendah sehingga memiliki kepekaan terhadap bahan pencemar dan dapat menggambarkan kualitas perairan tersebut. Nilai Indeks Keseragaman (E) berkisar antara 0,11-0,92 menunjukan bahwa penyebaran individu setiap jenis tidak merata, dan nilai Indeks Dominasi (C) berkisar antara 0,31-0,95 ini menandakan adanya dominansi yang cukup oleh salah satu spesies. Berdasarkan Uji Jarak Matsusita (DM) yang diperoleh model yang sesuai yaitu Model Motomura yang menggambarkan kondisi lingkungan perairan yang tidak stabil yaitu perairan telah mengalami pencemaran.