P engisian saluran akar yang kurang sempurna dapat menyebabkan kegagalan perawatan saluran akar yang memerlukan tindakan bedah periradikular. Bedah periradikular biasanya dilakukan bila terdapat kelainan periradikular dimana perawatan ulang saluran akar tanpa pembedahan tidak dapat dilakukan atau mengalami kegagalan. Bedah periradikular merupakan perawatan pilihan yang secara luas dapat diterima. Prosedur pembedahannya meliputi reseksi apeks, apikokuretase dan pengisian secara retrograde. Tujuan bedah periradikular ini adalah untuk menghilangkan rasa nyeri dan peradangan pada jaringan periapikal, yang disebabkan oleh pengisian yang overfilling dan underfilling. Keberhasilan reseksi apeks dapat ditingkatkan dengan menggunakan kombinasi antara preparasi ultrasonik dan penggunaan MTA sebagai bahan pengisi retrograde.