W Waduk Sunter Barat berada di Jalan Danau Sunter Selatan, Kelurahan Sunter Jaya, Kecamatan Tanjung Priok, Jakarta Utara, terletak pada koordinat 1060 20’ 00” Bujur Timur dan 060 10’ 00’’ Lintang selatan. Luas Waduk Sunter Barat ± 19 Ha. Fungsi Waduk ini adalah sebagai daerah tangkapan air, daerah resapan air dan pengendali banjir. Untuk mengetahui kualitas air selain berdasarkan parameter fisik dan kimia, fitoplankton dapat dijadikan parameter biologi untuk mengetahui tingat kesuburan perairan atau sebagai bioindikator. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis kualitas air Waduk Sunter, menganalisis struktur komunitas fitoplankton yang meliputi keanekaragaman, keseragaman, dominansi dan saprobitas di perairan Waduk Sunter Barat, menganalisis hubungan kelimpahan fitoplankton dengan sebaran nitrat dan fosfat di perairan, dan menganalisis hubungan produktivitas primer dengan kandungan klorofil-a dengan kemampuan laju karbon di perairan. Penelitian ini dilakukan pada bulan April s/d Juli 2016 dengan 11 titik lokasi pengambilan sampel, yang ditentukan berdasarkan inlet, zona tengah Waduk dan outlet. Parameter yang tidak sesuai baku mutu adalah kosentrasi DO berkisar antara 1,1-1,4 mg/ℓ, kosentrasi BOD berkisar antara 10,3-27,35 mg/ℓ, kosentrasi COD berkisar antara 23-130mg/ℓ, dan kosentrasi Fosfat berkisar antara 0,38-0,57mg/ℓ. Hubungan kelimpahan dengan konsentrasi nitrat dan fosfat adalah lemah, dimana nutrien dalam perairan tidak menggambarkan kondisi sesaat tetapi merupakan suatu proses perombakan dari nutrien yang masuk menjadi senyawa yang diserap oleh fitoplankton, oleh karena itu kondisi di Waduk Sunter Barat terlihat nilai N & P yang relatif rendah dengan kelimpahan yang tinggi mengindikasikan bahwa N dalam bentuk Nitrat telah terserap oleh fitoplankton. Kelimpahan fitoplankton yang ditemukan selama 4 kali pengambilan sampel berkisar antara 500 s/d 1202850 sel/ℓiter yang termasuk kedalam 6 Divisi yaitu Cyanophyta, Chrysophyta, Chlorophyta, Euglenophyta, Dinophyta Bacillariophyta. Kisaran nilai indeks pada Indeks Keanekaragaman (H’) 0,128 s/d 2,516, Indeks Keseragaman (E) 0,003 s/d 0,924 artinya perairan ini setengah tercemar, Indeks Dominansi (D) kisaran 0,183 s/d 0,96. Indeks dominansi (X) kisaran -1,28 s/d 0,20, artinya perairan ini termasuk kategori pencemaran sedang. Jenis fitoplankton yang sering ditemukan yaitu Oscillatoria sp 1 jenis ini memiliki sifat resisten terhadap bahan pencemar. Sumber pencemaran di Waduk Sunter Barat disebabkan oleh buangan organik dan anorganik dari aktivitas di sekitar Waduk Sunter barat terutama aktivitas rumah tangga. Nilai klorofil-a di Waduk Sunter Barat berkisar antara 3,2-386,9 mg/m3 atau 0,89 s/d 105,52 mgC/m3 dan karbon yang dapat diserap oleh fitoplankton berkisar antara 2 x109 s/d 14 x 109 Ton/Tahun atau 9x103 s/d 50x103 Ton/m3.