L Latar Belakang: Fusobacterium nucleatum adalah bakteri Gram-negatif yang berhubungan dengan infeksi endodontik. Beberapa gen pembentuk biofilm F. nucleatum telah teridentifikasi terlibat dalam interaksi interspesies. Probiotik Lactobacillus reuteri ialah bakteri non-patogenik yang diketahui dapat menghasilkan senyawa antimikroba spektrum luas berupa reuterin. Tujuan: Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui pengaruh reuterin isolat L. reuteri sebagai bahan irigasi terhadap ekspresi gen fadA, fomA, radD, dan aid1 biofilm F. nucleatum pada saluran akar gigi secara ex vivo. Metode: 24 sampel akar gigi premolar yang telah dipreparasi, diinokulasi dengan ko-kultur F. nucleatum dan Enterococcus faecalis selama 24 jam. Kemudian, sampel gigi diirigasi menggunakan larutan salin (kontrol negatif), NaOCl 2,5% (kontrol positif), reuterin isolat 25 μg/mL dan reuterin prodentis 25 μg/mL dengan waktu perlakuan 5 menit dan 30 menit. Sampel irigasi selanjutnya digunakan dalam perhitungan koloni dan Real Time-PCR untuk mendeteksi ekspresi gen fadA, fomA, radD, dan aid1 pembentuk biofilm F. nucleatum pada saluran akar gigi secara ex vivo. Hasil: Secara statistik, reuterin isolat L. reuteri 25 ug/mL mampu menurunkan ekspresi gen fadA, fomA radD, dan aid1 pembentuk biofilm F. nucleatum secara signifikan (p<0,05) pada saluran akar gigi (ex vivo) setelah diberi perlakuan selama 30 menit. Kesimpulan: Penelitian ini menunjukan bahwa reuterin isolat L. reuteri memiliki potensi sebagai bahan irigasi dalam perawatan saluran akar melalui kemampuannya dalam memengaruhi ekspresi gen fadA, fomA, radD, dan aid1 pembentuk biofilm F. nucleatum pada saluran akar gigi. Namun, penelitian lebih lanjut secara in vitro, in vivo, ex vivo, dan studi klinis lainnnya dengan jumlah populasi sampel yang lebih besar masih perlu dilakukan.