A Air limbah rumah pemotongan ayam (RPA) merupakan air limbah dengan kandungan organik tinggi, sehingga dapat mencemari badan air dan air tanah jika tidak diolah dengan baik. Salah satu pengolahan air limbah yang murah, mudah dioperasikan, efisiensi penyisihan tinggi,hemat energi dan telah banyak digunakan untuk mengolah air limbah rumah pemotongan ayam adalah dengan metode koagulasi-flokulasi. Penggunaan koagulan sintesis pada proses koagulasi dapat berefek buruk bagi kesehatan dan lingkungan, alternatif lain yang dapat dilakukan yaitu dengan menggunakan biokoagulan yang berasal dan hewan seperti cangkangkerang hijau. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui derajat deasetilasi kitosan cangkang kerang hijau, kecepatan dan pengadukan cepat optimum, waktu pengadukan lambat optimum, dosis koagulan optimum, waktu pengendapan optimum, perbandingan penggunaan koagulan aluminium sulfat dengan biokoagulan kitosan cangkang kerang hijau dalam menyisihkan BOD, COD dan TSS dalam air limbah rumah pemotongan ayam. Penentuan derajat deasetilasi kitosan dilakukan dengan metode FTIR. Pada penelitian skala laboratorium dilakukan variasi kecepatan pengadukan cepat 100, 150, 200 dan 250 rpm, variasi waktu pengadukan cepat 1, 2 dan 3 menit, variasi waktu pengadukan lambat 20, 25 dan 30 menit, dan variasi dosis koagulan 150, 200, 250 dan 300 mg/L. Pada penelitian skala pilot dilakukan variasi waktu pengendapan 1,5, 2, 2,5, 3 dan 3,5 jam. Hasil menunjukkan bahwa derajat deasetilasi kitosan sebesar 70%, kecpatan pengadukan cepat optimum sebesar 200 rpm selama 2 menit, waktu pengadukan lambat optimum 25 menit, dosis koagulan optimum 250 mg/L, waktu pengendapan optimum 2,5 jam. Koagulan aluminium sulfat efektif menyisihkan TSS, sementara biokoagulan kitosan cangkang kerang hijau efektif menyisihkan BOD dan COD.