DETAIL KOLEKSI

Analisis spektrum sekuen ekson asam deoksiribonukleid (DNA) Caenorhabditis Elegans menggunakan transformasi fourier diskrit

5.0


Oleh : Steven

Info Katalog

Penerbit : FTI - Usakti

Kota Terbit : Jakarta

Tahun Terbit : 2011

Pembimbing 1 : Suhartati Agoes

Subyek : Spectrum - analysis;Signal and signalling - process

Kata Kunci : exon deoxyribonucleid acid, fourier transform, spectral content, spectrum sequences

Status Posting : Published

Status : Lengkap


File Repositori
No. Nama File Hal. Link
1. 2011_TA_EL_06207003_1_Halaman-Judul.pdf
2. 2011_TA_EL_06207003_2_Bab1.pdf
3. 2011_TA_EL_06207003_3_Bab2.pdf
4. 2011_TA_EL_06207003_4_Bab3.pdf
5. 2011_TA_EL_06207003_5_Bab4.pdf
6. 2011_TA_EL_06207003_6_Bab5.pdf
7. 2011_TA_EL_06207003_7_Daftar-Pustaka.pdf
8. 2011_TA_EL_06207003_8_Lampiran.pdf

D Dalam sebuah urutan sekuen DNA, terdapat 4 jenis komponen basa yang berfungsi untuk membentuk asam amino yang merupakan komponen dasar dari protein dan DNA. Komponen basa ini dapat diidentifikasi dan diproses menggunakan teknologi digital dan bertujuan untuk mengukur besaran spektrum optimized dan besaran spektrum coding yang dihasilkan dengan menggunakan sistem pemrosesan sinyal yang dalam hal ini akan digunakan metode komputasi Transformasi Fourier Diskrit atau Discrete Fourier Transform (DFT). Besaran spektrum ini memiliki nilai maksimum yang berada pada urutan k = N/3. Tahapan untuk menghitung besaran spektrum optimized dan besaran spektrum coding adalah pengambilan ekson DNA dimana dalam penjelasan ini akan digunakan sekuen dari ekson DNA Caenorhabditis elegans (C.elegans) dengan nomor akses F56F11.4. Kemudian dengan menggunakan DFT, akan diperoleh nilai komponen basa tersebut pada posisi dimana nilai maksimum dihasilkan yaitu k = N/3. Setelah itu dilanjutkan dengan perhitungan matematis dan simulasi untuk besaran spektrum optimized dan proses simulasi besaran spektrum coding untuk membuktikan bahwa nilai puncak berada pada posisi k = N/3 dengan cara mencari nilai pada posisi k, k-1, dan k +1. Hasil dari perhitungan matematis dan simulasi menunjukkan nilai puncak besaran spektrum optimized dari ekson ke-2 DNA C.elegans dengan nomor akses F56F11.4. berada pada posisi k = N/3 yaitu sebesar 0.0048 jika dibandingkan dengan posisi k -1 yaitu 0.000423 dan posisi k +1 yaitu 0.0012. Hasil simulasi besaran spektrum coding ekson DNA C.elegans juga menunjukkan nilai maksimum berada pada posisi k = N/3 yaitu sebesar 11040 jika dibandingkan dengan posisi k-1 yaitu sebesar 5394 dan posisi k+1 sebesar 2676.

I In a sequence of DNA, there are 4 bases which used to form amino acid and it is the main component of protein and DNA. The bases could be identified and proceeded by using digital technology as the purpose to measure the optimized spectral content and coding spectral content using the signal processing in which the computational method is Discrete Fourier Transform (DFT). The spectral content has the peak value in k = N/3. The first step to calculate the optimized spectral content and coding spectral content are determining the exon of DNA which in the next will use the DNA exon sequence of Caenorhabditis elegans (C.elegans) accession number F56F11.4. Using DFT method and it can be determined the value of each bases where the peak value could be found in k = N/3. After that, calculate mathematicaly and using the simulation for optimized spectral content and using simulation to calculate the coding sepectral content in order to prove that the peak value typically appears in k = N/3 position by calculate the value in k, k-1, and k +1. The result of calculation mathematicaly and using simulation show that the peak value of the optimized spectral content for the second exon of DNA C.elegans accession number F56F11.4 appears in k = N/3 with 0.0048 compared by the value in k-1 resulting 0.000423 and the value in k+1 resulting 0.0012. The simulation result in calculating the coding spectral content of DNA exon of C.elegans show the peak value also appears in k = N/3 with 11040 compared by the value in k-1 and k+1 as 5394 and 2676 respectively.

Bagaimana Anda menilai Koleksi ini ?